Stornovat záznam OLPNO je možné, pouze pokud je ve stavu potvrzeno a pouze v případě, že při vyplňování údajů do ohlašovacího listu došlo k chybě a následně byl tento záznam označen jako potvrzený. Na rozdíl od klasického stornování přepravy dojde k propojení stornované přepravy s přepravou, která jí nahrazuje.
Storno s náhradou může provést pouze ohlašovatel přepravy a musí být zachováni původní účastníci.
Pokud nejsou zachováni stejní účastníci přepravy, je nutné OLPNO stornovat a poté založit nové s jinými účastníky a následně jej ohlašovatel / příjemce ohlásí do systému SEPNO zpětně.
Prvním krokem ke správnému použití storna s náhradou v modulu OLPNO, je vytvoření kopie nahrazované přepravy. Nejprve se provede označení daného potvrzeného záznamu, který bude nahrazován a následně se z něj vytvoří kopie pomocí klávesy F2, nebo ikonou v nástrojové liště. Důležitým krokem je editace samotné kopie záznamu, kde je třeba upravit dané parametry přepravy. Klasickým příkladem je editace hmotností odpadů. Storno s náhradou však nelze použít v případě, že byl špatně vyplněn jeden účastník přepravy. V takovém případě je třeba využít klasického storna. Po úpravě kopie lze přistoupit přímo ke stornování s náhradou. V dalším okně je potřeba uvést důvod stornování přepravy (pokud zaškrtnete Jiný je nutné ještě stručně okomentovat). V níže zvýrazněném okně se vybere předem vytvořená a zároveň opravená kopie přepravy. Po stornování ohlašovacího listu se změní stav záznamu na „Stornováno“ Nyní jste úspěšně dokončili stornování s náhradou.