Jako první je nutné zkontrolovat, zda máme IS ENVITA nastavený tak, abychom měli co nejjednodušší práci s programem. Pod záložkou ENVITA najdeme ikonu Nastavení, kde jsou všechny možnosti nastavení programu uloženy. Kompletní přehled je k dispozici v samostatném návodu zde: Sklad a Obchod - Nastavení.
Samotná evidence probíhá v agendách Výkup a Příjem a Prodej a Výdej. Do těchto agend jsou zadávány tzv. skladové doklady, které značí jednotlivé příjmy a výdeje. Více o tomto tématu zde: Založení skladového dokladu .
Jak je uvedeno výše, každý skladový doklad musí mít vyplněn způsob úhrady. Pro příjemky se jedná o způsoby: hotově, fakturou a neúčtovat. Hotovostní doklady jsou vypořádány (je vytvořen záznam do agendy Pokladna) v momentě jejich uložení.
Pro skladové doklady příjem a prodej, u kterých je nastavený způsob úhrady Fakturou, je možné se zaregistrovaným modulem Fakturace vygenerovat fakturu pro subjekt v roli Plátce na skladovém dokladu. Kompletní popis jak vytvářet faktury z modulu Sklad a Obchod najdeme zde: Fakturace.
Pro zařízení, které provádí úpravu odpadu, nebo jednoduché třídění je v IS ENVITA Sklad a Obchod připravena funkce předruhování v agendě Interní skladové doklady. Pomocí záznamů jednopoložkového předruhování je možné převádět jednu skladovou položku na jinou, nebo je možné využít vícepoložkové předruhování, v případě, že z jedné skladové položky vytřídíme více jiných, nebo naopak.
V té stejné agendě e také možné evidovat skladové přírůstky a úbytky, pokud je nutné pracovat pouze s jednou skladovou položkou a nevzniká následně jiná (např. vlastní produkce). Více informací o tom, jak evidovat předruhování je popsáno zde: Předruhování.
Aktuální stav skladových zásob a bilance je možné zobrazit v přehledu Souhrnný přehled skladových položek. Tento přehled zobrazuje údaje za nastavené období v programu a je možné z něj zjistit aktuální stav zásob, celkové příjmy, výdaje a vlastní produkci. Tento přehled je využívaný zejména během inventury, nebo při tvorbě ročního hlášení.